食品生产企业对监督抽检不合格检验结果有异议的，可以依法申请复检。程序主要依据《食品安全抽样检验管理办法》。具体步骤如下：1. **提出异议时限**：生产企业应当自收到不合格检验结论之日起7个工作日内，向组织实施抽样检验的市场监督管理部门（即作出公告的食药监局或其上级部门）提出书面复检申请，并说明理由。逾期未提出的，视为认可检验结果。2. **提交材料**：提交复检申请书、食品安全抽样检验结果通知书复印件、以及相关证明材料（如证明样品真实性、储存运输条件符合要求等）。3. **复检机构选择**：复检机构由受理复检的市场监督管理部门在公布的复检机构名录中随机确定，复检机构与初检机构不得为同一机构。复检机构无正当理由不得拒绝。4. **样品确认与移交**：市场监督管理部门会通知初检机构将备份样品移交至复检机构。生产企业可派员现场观察样品封条状态。5. **复检与结论**：复检机构按照规定的检验方法和判定标准对备份样品进行检验，出具复检结论为最终检验结论。复检结论表明食品合格的，复检费用由组织抽检的市场监督管理部门承担；结论不合格的，费用由申请人承担。需要注意的是，有下列情形之一的不予复检：（一）检验结论为微生物指标不合格的；（二）复检备份样品超过保质期的；（三）逾期提出复检申请的；（四）其他原因导致备份样品无法实现复检目的的。如果对复检结果仍有异议，可以针对市场监管部门依据该结果作出的行政处罚等具体行政行为，依法申请行政复议或提起行政诉讼。