不能简单地以“无证”为由不予补偿或压低补偿。根据《国有土地上房屋征收与补偿条例》第二十四条的精神，市、县级人民政府作出房屋征收决定前，应当组织有关部门依法对征收范围内未经登记的建筑进行调查、认定和处理。对认定为合法建筑和未超过批准期限的临时建筑的，应当给予补偿；对认定为违法建筑和超过批准期限的临时建筑的，不予补偿。因此，关键在于对“无证房屋”的合法性认定。对于因历史原因、管理制度不健全等非因当事人过错造成的无证房屋，在符合一定条件（如长期居住、唯一住房、符合规划等）下，经认定程序可以被视为合法建筑或给予适当补偿。您需要积极配合调查，提供能证明房屋来源、建造时间、历史使用情况等证据，争取在认定环节获得有利结果。若行政机关直接以无证为由决定不予补偿，您可以申请行政复议或提起行政诉讼。