该理由不合法，属于滥用行政权力、增设行政许可条件或违反平等原则的行为。科技项目补贴的申请与发放，属于行政给付行为，应遵循公开、公平、公正原则。维权途径如下：1. **法律依据**：行政机关实施行政管理，应当遵守法定程序，符合法定条件，不得设定无法律依据的内部限制（《行政许可法》精神及依法行政原则）。以“内部指标”为由拒绝受理，缺乏法律依据。2. **维权步骤**：首先，要求该主管部门出具书面的不予受理决定或说明，并明确其法律依据。其次，向其上级主管部门或同级人民政府申请行政复议，请求撤销该不予受理决定，并责令其依法受理您的申请。复议理由是：该决定适用依据错误、超越或滥用职权。最后，也可直接提起行政诉讼。3. **关键点**：重点在于证明您的申请完全符合公开的申报指南所列明的所有条件。行政机关的“内部指标”不能对抗对外公开发布的法定条件。收集并保存好您提交的申请材料、申报指南以及与该部门沟通的全部记录。