自然人股东需要缴纳个人所得税。根据《国家税务总局关于进一步加强高收入者个人所得税征收管理的通知》（国税发〔2010〕54号）及《国家税务总局关于股份制企业转增股本和派发红股征免个人所得税的通知》（国税发〔1997〕198号）等规定，股份制企业（包括股份有限公司和有限责任公司）用股票溢价发行收入所形成的资本公积金转增股本，不属于股息、红利性质的分配，不征收个人所得税。但用未分配利润、盈余公积金转增资本，应视为先分配利润再投资，对自然人股东取得的转增部分，需按“利息、股息、红利所得”项目，适用20%的税率征收个人所得税。公司有代扣代缴义务。