原则上无效，除非获得村民合法授权。根据《村民委员会组织法》第二十四条，涉及村民利益的重大事项，如征地补偿费的使用、分配方案，必须经村民会议讨论决定方可办理。村委会只是村民自治组织，其无权擅自处分村民的宅基地使用权和房屋所有权。如果村委会未召开村民会议或村民代表会议，未取得村民的明确书面委托，擅自签订的协议侵害了村民的合法权益，村民可以：1. 向乡、镇人民政府或县级人民政府举报，要求责令改正；2. 向人民法院提起民事诉讼，请求确认该协议无效；3. 在后续的征收程序中，坚持与法定的征收主体（市、县级人民政府或其指定的部门）直接协商签订补偿协议。