主要区别：1. 功能不同：普通商标标示商品来源（特定经营者），地理标志证明商标标示商品来源于某地区，且该商品的特定质量、信誉等主要由该地区的自然或人文因素决定。2. 主体不同：普通商标由经营者申请；地理标志证明商标由对商品具有监督能力的组织（如行业协会）申请，注册人自己不得使用，而是授权符合条件的企业使用。3. 使用管理：证明商标注册人需制定使用管理规则，监督商品品质。申请地理标志证明商标，除提交一般商标申请文件外，还需提交：主体资格证明、地理标志所标示地区的县级以上政府或主管部门的授权文件、商品特定品质与地域关联性的证明、使用管理规则等。