行政机关超过法定期限作出处罚决定，属于程序违法，但并不必然导致处罚决定无效。其法律后果需区分情况：1. 如果法律明确规定了超过期限即“不得再作出处罚”，则处罚决定因违反强制性规定而无效。例如，《行政处罚法》第三十六条规定了违法行为在二年内未被发现的，不再给予行政处罚（法律另有规定的除外）。这里的“二年”是追究时效，超期则丧失处罚权。2. 如果法律仅规定了行政机关办理案件的期限（如《行政处罚法》第六十条规定的90日办案期限），超期属于行政效率问题，是程序瑕疵。当事人可以此为由在复议或诉讼中主张程序违法，请求撤销处罚决定。但法院是否会撤销，需结合超期是否严重、是否影响处罚决定的正确性、是否侵害当事人权益等因素综合判断。轻微超期且未影响公正的，可能不被认定为撤销事由。但无论如何，超期行为本身是不规范的，当事人可向监察机关或上级机关反映。