可以主张追回。主要依据《商标法》第三十二条“申请商标注册不得损害他人现有的在先权利，也不得以不正当手段抢先注册他人已经使用并有一定影响的商标”。程序如下：1. 收集证据：证明公司在先使用该商标（如产品宣传、参展资料、销售合同等），以及该员工因职务关系知悉商标的证据（劳动合同、工作邮件等）。2. 在商标初审公告期内（3个月内）向商标局提出异议（依据《商标法》第三十三条）。3. 若商标已注册，自注册之日起5年内可请求商标评审委员会宣告该商标无效（依据《商标法》第四十四条、四十五条）。若该员工行为构成《反不正当竞争法》第六条规定的混淆行为，还可提起民事诉讼要求停止侵权并赔偿。建议尽快行动，并考虑同时发送律师函施压。