需要区分情况处理：1. **关于扣发工资**：根据《工资支付暂行规定》，用人单位不得克扣劳动者工资。员工已提供劳动部分的工资必须足额支付。对于未提前30天通知（试用期未提前3天）而擅自离职给公司造成的直接经济损失，公司可以要求赔偿，但不能直接扣发其已工作期间的工资作为“罚款”或“违约金”。2. **关于要求赔偿**：根据《劳动合同法》第九十条，劳动者违法解除劳动合同（如未提前通知擅自离职），给用人单位造成损失的，应当承担赔偿责任。公司需要举证证明存在直接经济损失（如紧急顶岗产生的额外费用、客户违约损失等），且损失与员工擅自离职有直接因果关系。实践中举证难度较大。建议：公司应首先与员工沟通，办理工作交接；完善规章制度，明确擅自离职的处理程序；对于造成重大损失的，可依法追偿。