需视合同约定及资料不完整的严重程度而定。提交完整的竣工资料是承包人的法定义务和合同附随义务（《建设工程质量管理条例》第十六条）。如果合同明确约定“提交完整竣工资料”是支付尾款的前提条件，且资料缺失影响工程备案、使用或后续维护，发包人可能有权行使先履行抗辩权，暂拒付款。但该抗辩需遵循诚信原则和比例原则。若资料仅为次要文件缺失，不影响大局，发包人不能以此为由拒绝支付主要款项，但可要求承包人限期补正并保留索赔权利。实务中，发包人应发函催告承包人限期提交，并明确逾期后果。承包人应重视资料归档，避免因小失大。