承包人应立即停止施工，保护现场，并报告当地文物行政部门。根据《文物保护法》第三十二条，在进行建设工程或者在农业生产中，任何单位或者个人发现文物，应当保护现场，立即报告当地文物行政部门。由此导致的停工、窝工损失，原则上应由发包人承担。法律依据是《民法典》第八百零三条，因发包人原因（此处可理解为发包人提供的施工场地存在未知文物这一客观障碍，属于发包人应承担的风险）造成停工的，承包人可以顺延工期，并有权要求赔偿损失。双方可在合同中预先约定此类不可预见地下障碍物的处理程序和费用承担方式。承包人务必做好停工记录、报告凭证、损失计算等证据保全工作。